More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3594 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0182  methylthioadenosine phosphorylase  57.31 
 
 
254 aa  318  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00638501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  46.25 
 
 
263 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1225  purine phosphorylase family 2  48.28 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.338671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  40.76 
 
 
253 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  40.76 
 
 
253 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  40.76 
 
 
253 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  44.53 
 
 
268 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.34 
 
 
260 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.34 
 
 
261 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.35 
 
 
263 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  40.55 
 
 
257 aa  201  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  44.44 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  40.87 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  41.22 
 
 
262 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  41.27 
 
 
265 aa  198  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  38.13 
 
 
279 aa  198  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1187  purine phosphorylase family 2  40.34 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  42.69 
 
 
256 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.18 
 
 
263 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  37.36 
 
 
263 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  42.02 
 
 
292 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  40.7 
 
 
270 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.22 
 
 
286 aa  181  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  41.47 
 
 
269 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.28 
 
 
267 aa  175  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  38.43 
 
 
246 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.96 
 
 
280 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.86 
 
 
280 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38 
 
 
267 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  39.69 
 
 
264 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.43 
 
 
246 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.29 
 
 
248 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.59 
 
 
245 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.65 
 
 
280 aa  166  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  37.94 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.82 
 
 
245 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  36.36 
 
 
268 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  37.92 
 
 
243 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.34 
 
 
280 aa  159  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.5 
 
 
245 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.95 
 
 
273 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  37.6 
 
 
269 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  35.55 
 
 
262 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.5 
 
 
245 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.7 
 
 
267 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  42.72 
 
 
255 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.78 
 
 
245 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0134  purine phosphorylase family 2  32.6 
 
 
280 aa  156  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  34.84 
 
 
250 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0457  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  37.3 
 
 
257 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  39.81 
 
 
257 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  39.17 
 
 
252 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  35.16 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  35.16 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.18 
 
 
256 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  35.02 
 
 
264 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  36.76 
 
 
302 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  35.41 
 
 
301 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  38.68 
 
 
248 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.94 
 
 
253 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  35.16 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  33.6 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2403  methylthioadenosine phosphorylase  34.14 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.62 
 
 
258 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.62 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.62 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.66 
 
 
248 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.3 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.58 
 
 
305 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  37.21 
 
 
286 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.17 
 
 
243 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.63 
 
 
258 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  34.98 
 
 
244 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.29 
 
 
245 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  33.86 
 
 
286 aa  141  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  35.69 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  37.22 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  34.23 
 
 
294 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  33.46 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  34.66 
 
 
284 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  33.46 
 
 
294 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  36.28 
 
 
290 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.45 
 
 
248 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.55 
 
 
246 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.2 
 
 
264 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.73 
 
 
248 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.68 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  34.16 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  34.16 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0780  purine or other phosphorylase family 1  36.36 
 
 
224 aa  135  9e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.863354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1889  methylthioadenosine phosphorylase  34.58 
 
 
241 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  33.46 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  32.14 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  36.4 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  36.4 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.07 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.07 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  33.7 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>