More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2403 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2403  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
276 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  41.34 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  42.08 
 
 
265 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.47 
 
 
263 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  41.18 
 
 
263 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.94 
 
 
260 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.49 
 
 
262 aa  183  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.06 
 
 
261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.84 
 
 
263 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  40.08 
 
 
292 aa  171  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  36.92 
 
 
257 aa  170  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  44.44 
 
 
258 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  38.55 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  41.92 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  38.02 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  38.02 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  37.6 
 
 
253 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  37.02 
 
 
264 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  37.4 
 
 
256 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  34.47 
 
 
279 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0182  methylthioadenosine phosphorylase  37.5 
 
 
254 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00638501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.98 
 
 
267 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1187  purine phosphorylase family 2  36.21 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  41.78 
 
 
257 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  35.06 
 
 
269 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.37 
 
 
248 aa  148  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.21 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  34.21 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  34.14 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  32.83 
 
 
279 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 
270 aa  145  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40 
 
 
280 aa  144  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40 
 
 
280 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.02 
 
 
280 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  37.33 
 
 
252 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.19 
 
 
248 aa  142  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  33.33 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  34.82 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  34.82 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39 
 
 
256 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.6 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  36.23 
 
 
255 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  35.56 
 
 
246 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.68 
 
 
258 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.16 
 
 
245 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  34.31 
 
 
257 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.08 
 
 
267 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  33.98 
 
 
263 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.68 
 
 
258 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.68 
 
 
258 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.63 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.82 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.91 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  36.41 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  37.21 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.57 
 
 
245 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.98 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  34.02 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  32.72 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  35.21 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.02 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.54 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.97 
 
 
267 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  33.33 
 
 
264 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.54 
 
 
290 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.44 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.02 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  32.72 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.48 
 
 
245 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  31.8 
 
 
294 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.07 
 
 
291 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  36.97 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.78 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.6 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  34.93 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.02 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  32.7 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.94 
 
 
297 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.07 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  35.38 
 
 
286 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.54 
 
 
290 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  34.44 
 
 
293 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  34.44 
 
 
293 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.54 
 
 
290 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1225  purine phosphorylase family 2  34.31 
 
 
245 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.338671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  34.62 
 
 
244 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  34.36 
 
 
297 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  31.82 
 
 
287 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  34.02 
 
 
293 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  32.52 
 
 
245 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.07 
 
 
291 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.07 
 
 
291 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.07 
 
 
291 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.02 
 
 
291 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.55 
 
 
291 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  32.24 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  34.87 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  34.58 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.6 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  30.27 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>