More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  98.37 
 
 
245 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  81.22 
 
 
245 aa  417  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  79.51 
 
 
246 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  78.78 
 
 
245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  79.1 
 
 
246 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  76.13 
 
 
245 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  60.25 
 
 
262 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.4 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  55 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  58.82 
 
 
248 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  55.65 
 
 
245 aa  261  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  58.02 
 
 
270 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  58.02 
 
 
270 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.38 
 
 
245 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  52.5 
 
 
255 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0457  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.5 
 
 
246 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  53.94 
 
 
243 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.53 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.24 
 
 
248 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.08 
 
 
253 aa  234  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.79 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.79 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.85 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.62 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  47.33 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.37 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  44.77 
 
 
263 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  46.06 
 
 
265 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  36.51 
 
 
279 aa  193  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.49 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.74 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  40.33 
 
 
268 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  44.58 
 
 
263 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.33 
 
 
261 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.59 
 
 
263 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  44.07 
 
 
292 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  35.68 
 
 
269 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  37.29 
 
 
270 aa  167  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.24 
 
 
262 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  41 
 
 
269 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  37.76 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  45.75 
 
 
301 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  43.41 
 
 
298 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  35.8 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.74 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.6 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  40.59 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  39.11 
 
 
258 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.66 
 
 
280 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  39 
 
 
279 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.08 
 
 
267 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.91 
 
 
267 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  42.93 
 
 
294 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  37.5 
 
 
258 aa  158  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  39.34 
 
 
294 aa  158  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  32.77 
 
 
263 aa  158  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  38.75 
 
 
264 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  34.71 
 
 
268 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  34.71 
 
 
257 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  42.93 
 
 
294 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  36.02 
 
 
284 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  37.5 
 
 
290 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 
287 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  45.05 
 
 
257 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.82 
 
 
280 aa  155  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.46 
 
 
291 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  36.51 
 
 
280 aa  153  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  40.98 
 
 
298 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  39.75 
 
 
264 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.61 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  39.13 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.98 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.98 
 
 
291 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  35.14 
 
 
253 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  38.94 
 
 
286 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  36.7 
 
 
252 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.25 
 
 
267 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.46 
 
 
291 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  35.14 
 
 
253 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  42.03 
 
 
297 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0134  purine phosphorylase family 2  34.39 
 
 
280 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.98 
 
 
291 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.33 
 
 
258 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.33 
 
 
258 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.33 
 
 
258 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  40.1 
 
 
303 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  39.42 
 
 
287 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.68 
 
 
294 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  34.68 
 
 
253 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.95 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  34.57 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.5 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  40.1 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.06 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.88 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  38.33 
 
 
287 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  40.1 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  36.99 
 
 
303 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  34.71 
 
 
291 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>