63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0129 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  90.23 
 
 		 174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  57.43 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  51.63 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  51.63 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  50.3 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  51.63 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  53.02 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  47.22 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  48.98 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  48.98 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  48.98 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  48.98 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  48.3 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  47.52 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  47.52 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  47.52 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  47.52 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  47.52 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  47.52 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  46.53 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  46.81 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  46.81 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  37.96 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  30.26 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  30.43 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  30.66 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  37.63 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  33.67 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  33.67 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  33.67 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  33.67 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  30.67 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  32.65 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  29.05 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  31.54 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  29.05 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  29.05 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  29.05 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  29.05 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  28.38 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  31.85 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  28.38 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  32.41 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  30.56 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  32.17 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  33.01 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  47.17 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  29.41 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  27.07 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  35.71 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  31.25 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  27.41 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  27.21 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  29.9 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  27.48 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  26.72 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  27.01 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  27.81 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  32.97 
 
 		 170 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  25.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  25.5 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>