75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1987 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  96.27 
 
 		 161 aa  309  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  93.79 
 
 		 161 aa  289  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  93.79 
 
 		 161 aa  289  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  93.79 
 
 		 161 aa  289  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  93.17 
 
 		 161 aa  288  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  93.17 
 
 		 161 aa  288  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  93.17 
 
 		 161 aa  287  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  93.17 
 
 		 161 aa  287  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  85.09 
 
 		 161 aa  264  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  85.09 
 
 		 161 aa  264  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  84.47 
 
 		 161 aa  263  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  84.47 
 
 		 161 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  83.85 
 
 		 161 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  79.01 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  55.76 
 
 		 162 aa  166  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  50 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  51.33 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  55.62 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  48.68 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  36.75 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  36.75 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  36.75 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  34.04 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  41.41 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  37.04 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  36.99 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  34.67 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  38.89 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  33.33 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  38.26 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  31.76 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  32.88 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  32.88 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  32.88 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  32.88 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  32.88 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  35.46 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  32.89 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  32.19 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  34.97 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  31.51 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  31.69 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  31.51 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  31.33 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  32.21 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  37.19 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  32.61 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  36.75 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  27.46 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  31.62 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  30.91 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  35.54 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  35.54 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  33.03 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  30.88 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  33.96 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00534  hypothetical protein  29.23 
 
 		 275 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  29.2 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  31.47 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4322  lipoprotein signal peptide  29.71 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00684015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4212  putative lipoprotein signal peptide  29.71 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1921  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22740  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443318  normal  0.0477687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  32.04 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05425  lipoprotein signal peptide  28.44 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0986  hypothetical protein  29.41 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  31.96 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  29.7 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  27.21 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>