54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4032 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  100 
 
 		 190 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  56.25 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  51.52 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  50.3 
 
 		 174 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  53.64 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  53.64 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  53.64 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  53.64 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  52.98 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  53.79 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  53.79 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  53.03 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  53.03 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  53.03 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  53.03 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  53.03 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  53.03 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  51.85 
 
 		 170 aa  138  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  45.73 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  58.2 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  58.1 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  58.1 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  58.1 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  34.91 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  39.33 
 
 		 158 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  36.61 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  35.79 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  34.74 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  31.82 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  31.82 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  30.91 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  30.91 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  30.91 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  30.91 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  30.91 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  30.91 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  30.91 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  31.91 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  31.91 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  31.91 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  31.91 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  31.91 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  30.85 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  26.58 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  34.04 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  30 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  25.32 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  46.3 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  30 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  25 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  27.27 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  28 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  25.25 
 
 		 163 aa  41.6  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  26.21 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>