56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3849 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  56.25 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  57.43 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  55.41 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  49.04 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  49.04 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  49.04 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  47.59 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  47.59 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  47.59 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  47.59 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  47.59 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  47.59 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  60 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  60 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  60 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  60 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  60 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  47.59 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  47.59 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  43.64 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  47.65 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  52.78 
 
 		 147 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  28.95 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  32.11 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  28.67 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  30.34 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  33 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  30.82 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  30.14 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  32.32 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  32.32 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  31.31 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  31.31 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  31.31 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  31.31 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  31.63 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  31.31 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  31.31 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  31.63 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  31.31 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  31.31 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  31.31 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  48.15 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  29.55 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  31.91 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  26.26 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  25.57 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  28.42 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  29.45 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  27.72 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  25.81 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  31.58 
 
 		 159 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  26.76 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  27.27 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>