63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0137 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  90.23 
 
 		 174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  51.52 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  52.94 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  52.94 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  52.94 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  55.41 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  54.3 
 
 		 147 aa  148  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  49.66 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  49.66 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  49.66 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  49.66 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  48.98 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  52.54 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  50.36 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  50.36 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  50.36 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  50.36 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  50.36 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  50.36 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  49.3 
 
 		 170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  49.64 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  49.64 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  38.89 
 
 		 166 aa  87.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  29.8 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  31.58 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  29.73 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  30.41 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  33.03 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  34.69 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  34.69 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  34.69 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  34.69 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  33.67 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  30.41 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  30.41 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  33.81 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  30.41 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  30.41 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  30.41 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  33.33 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  29.73 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  29.73 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  34.03 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  28.47 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  32.87 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  33.01 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  30.97 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  47.17 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  28.87 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  26.81 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  31.31 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  25.5 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  33 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  28.15 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  27.74 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  28.57 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  27.68 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  30.14 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  27.35 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  25.48 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>