76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2037 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  99.38 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  99.38 
 
 		 161 aa  323  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  98.76 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  90.06 
 
 		 161 aa  300  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  90.68 
 
 		 161 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  90.68 
 
 		 161 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  90.68 
 
 		 161 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  90.06 
 
 		 161 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  90.06 
 
 		 161 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  89.44 
 
 		 161 aa  269  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  89.44 
 
 		 161 aa  269  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  85.09 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  79.01 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  59.39 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  57.67 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  50.33 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  51.63 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  50.66 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  36.81 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  36.81 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  36.81 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  37.84 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  41.96 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  33.56 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  36.05 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  36.77 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  33.77 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  32.9 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  32.43 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  39.62 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  38.4 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  34.69 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  31.08 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  32.43 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  32.43 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  32.43 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  32.43 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  32.43 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  34.87 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  32.43 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  31.82 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  31.82 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  34.01 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  31.82 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  36.72 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  31.72 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  30.2 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  35.16 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  38.38 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  35.16 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  35.16 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  31.91 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4212  putative lipoprotein signal peptide  36.21 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4322  lipoprotein signal peptide  36.21 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00684015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  35.05 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  27.21 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  32.11 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22740  hypothetical protein  36.24 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443318  normal  0.0477687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1921  hypothetical protein  36.24 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  29.58 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  37.74 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  33.33 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_003296  RS05425  lipoprotein signal peptide  32.43 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  32.04 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  35.05 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1674  hypothetical protein  27.01 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  42  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2530  hypothetical protein  31.68 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00527013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  29.51 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1680  hypothetical protein  26.28 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>