76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4476 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  100 
 
 		 163 aa  333  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  86.5 
 
 		 163 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  85.28 
 
 		 163 aa  288  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  80.98 
 
 		 163 aa  273  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  72.99 
 
 		 174 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  71.84 
 
 		 174 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  71.84 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  71.84 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  49.33 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  48.39 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  45.57 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  43.56 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  43.62 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  40.54 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  35.93 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  40.5 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  40.5 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  33.75 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  34.67 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  40.87 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  39.67 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  39.67 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  39.67 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  39.67 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  39.67 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  39.67 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  31.79 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  39.62 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  39.62 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  39.62 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  39.62 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  39.62 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  31.33 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  35.1 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  35.1 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  35.1 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  34.69 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  33.81 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  32.67 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  31.85 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  32.64 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  32.19 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  32.19 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  31.21 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  35.79 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  28.19 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  28.19 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  35.79 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  28.19 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  28.19 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  28.19 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  33.33 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  27.5 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  33.33 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  32.41 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  33.33 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  30 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  31.21 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  33.33 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  30.19 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  28.67 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  30.99 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  30.48 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  31.47 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00534  hypothetical protein  32.77 
 
 		 275 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1674  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  27.72 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1680  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  26.95 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  27.39 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>