72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1899 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  100 
 
 
161 aa  327  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  100 
 
 
161 aa  327  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  99.38 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  99.38 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  99.38 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  99.38 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  99.38 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  98.76 
 
 
161 aa  324  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  93.17 
 
 
156 aa  270  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  90.06 
 
 
161 aa  270  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  90.06 
 
 
161 aa  270  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  89.44 
 
 
161 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  89.44 
 
 
161 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  88.82 
 
 
161 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  81.48 
 
 
162 aa  240  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  55.76 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  51.59 
 
 
158 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  55.62 
 
 
162 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  50.99 
 
 
157 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  50.66 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  38.32 
 
 
162 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  38.32 
 
 
162 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  38.32 
 
 
162 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  36.59 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  37.84 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  37.72 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  36.73 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  42.86 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  35.19 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  33.33 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  38.02 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  32.45 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  32.45 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  32.45 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  32.45 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  32.45 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  36.49 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  36.18 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  30.41 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  32.89 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  30.41 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  30.41 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  30.41 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  30.41 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  30.41 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  30.41 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  30.41 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  29.73 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  38.02 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  34.25 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  37.61 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  30.87 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  28.38 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  36.36 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  30.91 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  30.82 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  33.03 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  30.71 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1921  hypothetical protein  35.62 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22740  hypothetical protein  35.62 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443318  normal  0.0477687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  34.02 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  33.02 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  28.87 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  32.67 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4322  lipoprotein signal peptide  31.9 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00684015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4212  putative lipoprotein signal peptide  31.9 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  27.03 
 
 
166 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00534  hypothetical protein  27.34 
 
 
275 aa  44.3  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0986  hypothetical protein  31.47 
 
 
282 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05425  lipoprotein signal peptide  24.11 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>