69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2662 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  36.94 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  34.39 
 
 		 178 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  28.1 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  33.91 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  29.55 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  34.02 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  35.05 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  35.05 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  34.02 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  34.02 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  34.02 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  34.02 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  29.05 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  27.78 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  35.11 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  35.11 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  35.11 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  25.33 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  25.33 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  26.62 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  31.96 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  26.62 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  26.62 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  26.28 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  26.62 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  26.28 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  26.62 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  26.45 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  26.28 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  26.28 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  26.28 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  26.28 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  25.62 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  33 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  28.57 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  28.76 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  32 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  30.61 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  25.33 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  30.28 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  27.45 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  30.51 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22740  hypothetical protein  27.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443318  normal  0.0477687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  29.9 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1921  hypothetical protein  27.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3119  hypothetical protein  28.81 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  30.51 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  27.27 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3879  hypothetical protein  26.85 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  26.95 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  30.7 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  29.8 
 
 		 163 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  31.07 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  33.33 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  29.22 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  29.21 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1482  hypothetical protein  28.12 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109607  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3793  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000194694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  29.66 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  29.66 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>