70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4459 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  100 
 
 
159 aa  323  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  30.51 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  31.21 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  30.5 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  29.79 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  38.38 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  33.61 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  38.38 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  33.03 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  38.38 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  38.38 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  29.08 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  38.38 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  41.67 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  34.91 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  30.46 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  35.78 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  34.29 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  33.33 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  34.29 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  33.07 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  35 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  32.06 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  32.33 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  33.33 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  28.87 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  38.04 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  29.09 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  30.25 
 
 
167 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  28.46 
 
 
180 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  34 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00534  hypothetical protein  27.47 
 
 
275 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  34 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  27.66 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  31.68 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1680  hypothetical protein  30.23 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1674  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  30.3 
 
 
185 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  30.43 
 
 
168 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  31.46 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  27.74 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  29.29 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  29.29 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  26.06 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  26.06 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  26.06 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  33.78 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  33.78 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  33.78 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  33.78 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  33.78 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  26.51 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  29.29 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  27.01 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  29.29 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  29.29 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  29.29 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  29.29 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  29.29 
 
 
167 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  43.9  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  33.78 
 
 
170 aa  43.9  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3274  hypothetical protein  36.46 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0409837  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  31.58 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  27.45 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  34.58 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04787  hypothetical protein  36.9 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>