20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3120 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  319  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  42.48 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  33.72 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  37.27 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  38.54 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  33.12 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  35.64 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  30.66 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1544  hypothetical protein  34.07 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  31.34 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  28.16 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  32.37 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.57 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.57 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.57 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  26.28 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  31.96 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  28 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  28 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>