42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0677 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  44.04 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  37.86 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  31.37 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  35.78 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0717  hypothetical protein  26.09 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  29.87 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  25.33 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  30.32 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  35.23 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05425  lipoprotein signal peptide  33.82 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  29.49 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  26.45 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  31.33 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  29.82 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  29.17 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  29.19 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  27.03 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  32.04 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  25.18 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  27.27 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  29.91 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1544  hypothetical protein  27.91 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2279  protein of unknown function Spy-related  26.75 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4322  lipoprotein signal peptide  32.08 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00684015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4212  putative lipoprotein signal peptide  32.08 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  27.22 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2376  hypothetical protein  29.47 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  29.53 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  27.95 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  25.87 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  29.61 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  29.61 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  29.61 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0471  hypothetical protein  29.55 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  27.5 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2300  protein of unknown function, Spy-related  26.51 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000365275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  27.39 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  26.88 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  28.12 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>