41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1376 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  36.89 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  34.83 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  37.63 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  33.68 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  32.63 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  28.76 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  27.66 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  32.22 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  30.58 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  32.74 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  30.11 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  34.91 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  32.74 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  32.74 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  32.67 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  31.13 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  32.04 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  32.04 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  32.04 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  32.04 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  32.04 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  29.36 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  32.67 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  32.67 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  30.97 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  30.19 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  32.04 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  32.04 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  32.04 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  32.04 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  31.07 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  31.07 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  31.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.53 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  38.1 
 
 		 3787 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.53 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.53 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  36.51 
 
 		 580 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  36.96 
 
 		 975 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  35.09 
 
 		 2532 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>