More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0407 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  50.76 
 
 
200 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  51.01 
 
 
200 aa  191  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  50.25 
 
 
200 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.65 
 
 
203 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.22 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.71 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  36.18 
 
 
215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.98 
 
 
211 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  34.5 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  32 
 
 
213 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  35.38 
 
 
214 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  34.34 
 
 
222 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
219 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  37.23 
 
 
206 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.85 
 
 
207 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 
200 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
219 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  33.85 
 
 
222 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
213 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  34 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  36.36 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  31.31 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  31.31 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
204 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
204 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  35 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.35 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  34.2 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  33.17 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  28.04 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  33.85 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  30.63 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.94 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  31.41 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  29.36 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  30.1 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  30.1 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  30.09 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.09 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.09 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  26.91 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  31.1 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  29.07 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  29.5 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.98 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  28.9 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  27.52 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  28.3 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.63 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  32.04 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.63 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  31.55 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.09 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  30.05 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  28.29 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  27.52 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.44 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  31.07 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.75 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  30.29 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  28.44 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  34.75 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  28.37 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  30.28 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  29.19 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  27.06 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  28.43 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  25.37 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00444  glutathione S-transferase  44.29 
 
 
116 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0188129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.83 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  27.83 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  25.79 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.83 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.37 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  27.01 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.93 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.42 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  26.82 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  28.4 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  24.26 
 
 
211 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>