More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5220 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  96.8 
 
 
219 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  77.98 
 
 
222 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  77.52 
 
 
222 aa  331  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  72.46 
 
 
213 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  59.7 
 
 
211 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  53.96 
 
 
215 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  57.36 
 
 
214 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  53.37 
 
 
214 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  56.65 
 
 
206 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.26 
 
 
211 aa  228  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.67 
 
 
211 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.52 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 
200 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  43.23 
 
 
210 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  43.01 
 
 
198 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.23 
 
 
210 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.58 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  43.01 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  39.11 
 
 
213 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  38.81 
 
 
201 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.23 
 
 
214 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 
207 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.23 
 
 
211 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  40.87 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  39.05 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  38.69 
 
 
208 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  39.05 
 
 
213 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.81 
 
 
213 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.37 
 
 
213 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  38 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 
203 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  38.19 
 
 
208 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  36.97 
 
 
211 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  37.06 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00444  glutathione S-transferase  53.4 
 
 
116 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0188129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 
204 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  36.55 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.55 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  34.6 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 
204 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.07 
 
 
207 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.93 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.69 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.3 
 
 
209 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
210 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
210 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.24 
 
 
202 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  36 
 
 
197 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
207 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
209 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  32.55 
 
 
220 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
211 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
209 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  36.23 
 
 
200 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  32.67 
 
 
203 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  32.64 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  31.03 
 
 
218 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.12 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  33 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  33.82 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.74 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  32.5 
 
 
201 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  31.61 
 
 
185 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  32.14 
 
 
183 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  33.8 
 
 
200 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  34.62 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.85 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  34.5 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.29 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  33.49 
 
 
234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  33.49 
 
 
234 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  32.35 
 
 
202 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
234 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
234 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
234 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  30.15 
 
 
186 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  30.15 
 
 
186 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.32 
 
 
199 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  29.41 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  31.84 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.85 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  30.88 
 
 
201 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  32.26 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.94 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  29.67 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 
211 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
202 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>