More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2020 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.88 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  46 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.75 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  45.5 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  44.28 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  42.71 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  36.18 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  38.19 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  39.5 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  33.97 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  36.68 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.95 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  37.24 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.89 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  39.09 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  33.66 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  35.68 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 		 219 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  34.17 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.02 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.42 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  32.67 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.83 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  32.32 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  32.32 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  32.84 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.8 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  31.84 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  34 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  31.35 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  32.07 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  29 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  36.31 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  33.02 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  29.56 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.78 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.35 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  28.85 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  30.37 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  27.72 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  29.41 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.56 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.56 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.58 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  32.6 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  26.87 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  32.04 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  32.6 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  25.69 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  32.04 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  30.43 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  30.43 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  30.43 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.35 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  26.7 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  29.9 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  29.58 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  40.38 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.52 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  29.15 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.54 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  26.11 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.35 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  27.54 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  28.87 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.22 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  27.85 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  27.84 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  27.67 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  30.62 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  29.15 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  30.94 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.85 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  30.6 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  26.26 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  27.57 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  27.4 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>