More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0065 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  83.54 
 
 		 474 aa  846    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  84.93 
 
 		 473 aa  852    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0065  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 476 aa  980    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  84.36 
 
 		 473 aa  851    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0825  cysteinyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 466 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 453 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 468 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 485 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 459 aa  356  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 485 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 465 aa  356  5e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 469 aa  353  5e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 461 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 479 aa  352  8e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 460 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 460 aa  350  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1831  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 469 aa  349  6e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 485 aa  348  8e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 493 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 500 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 466 aa  346  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 465 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 478 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 480 aa  342  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 480 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 487 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>