63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02422 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02422  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3368  Methyltransferase type 12  48.43 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37268  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2752  hypothetical protein  30.84 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  29.25 
 
 		 1287 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.17 
 
 		 1291 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  30.08 
 
 		 1274 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2676  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4180  hypothetical protein  27.48 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0921  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  30.63 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.85 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 474 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.85 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  25.23 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.61 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  24.52 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.96 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.23 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  33.67 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.37 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 1340 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.61 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.61 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  25.13 
 
 		 457 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.61 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5245  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 227 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4966  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 227 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4877  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 227 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 228 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 226 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 220 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.27 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 468 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 273 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.88 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 360 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>