45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2752 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2752  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4180  hypothetical protein  58.12 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0921  hypothetical protein  55.22 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2676  Methyltransferase type 11  47.74 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 		 1291 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  36.29 
 
 		 1287 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  31.01 
 
 		 1274 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3368  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37268  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02422  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  33.91 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  28.79 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  32.86 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  29.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  27.5 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  24.09 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  30.51 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  27.18 
 
 		 288 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.99 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.14 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  43.86 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.03 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  23.81 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  34.72 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 344 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  27.97 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  30 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 508 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  28.12 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 236 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 282 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>