38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3368 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3368  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37268  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02422  hypothetical protein  48.43 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2752  hypothetical protein  32.57 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.56 
 
 		 1291 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2676  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  28.17 
 
 		 1274 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4180  hypothetical protein  27.85 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  27.64 
 
 		 1287 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  25.19 
 
 		 457 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  38.18 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  31.21 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.23 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  38.37 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  27.06 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  24.44 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  38.37 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00376  hypothetical protein  26.89 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.985484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0422  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.69 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50330  hypothetical protein  33.04 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.271099  hitchhiker  0.000351246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  38.03 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.63 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.29 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  37.8 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  37.88 
 
 		 254 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  25.41 
 
 		 207 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  37.8 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 246 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>