22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4180 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4180  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2752  hypothetical protein  58.12 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0921  hypothetical protein  50.21 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2676  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.46 
 
 		 1291 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  27.21 
 
 		 1274 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 		 1287 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  25.56 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  29.82 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  40 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 360 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 251 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  35.71 
 
 		 275 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 360 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 		 275 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.71 
 
 		 275 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 242 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3368  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 238 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37268  normal  0.993388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>