53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0921 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0921  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2752  hypothetical protein  55.22 
 
 
244 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4180  hypothetical protein  50.21 
 
 
240 aa  235  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2676  Methyltransferase type 11  49.38 
 
 
260 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  32.26 
 
 
1274 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.22 
 
 
1291 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  36.97 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.16 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  30.47 
 
 
1287 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.72 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  34.88 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02422  hypothetical protein  28.75 
 
 
231 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32 
 
 
420 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 
337 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  27.06 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.64 
 
 
246 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  30.57 
 
 
317 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  28.57 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
352 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  29.01 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  37.37 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  35.34 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.8 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  30.47 
 
 
348 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
324 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.12 
 
 
202 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  28.57 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  28.03 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  31.34 
 
 
411 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  33.09 
 
 
353 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  31.36 
 
 
198 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  26.6 
 
 
318 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  25.75 
 
 
311 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2130  hypothetical protein  28.29 
 
 
254 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.143043  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
255 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  31.45 
 
 
217 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  27.87 
 
 
345 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 
204 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
214 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
252 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>