More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1034 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1034  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19041  ABC transporter ATP-binding protein  98.7 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.362755  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15231  ABC transporter ATP-binding protein  79.39 
 
 
234 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11251  ABC transporter ATP-binding protein  62.86 
 
 
256 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.191438  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11331  ABC transporter ATP-binding protein  63.67 
 
 
256 aa  321  7e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.978204  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11331  ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1042  ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.309618  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29271  ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 
262 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1365  ATPase  48.89 
 
 
231 aa  215  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90263  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1605  ATPase  46.88 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
255 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.77 
 
 
255 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
236 aa  157  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  40.52 
 
 
248 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
255 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  37.56 
 
 
245 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  37.93 
 
 
246 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  37.05 
 
 
266 aa  151  8e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
249 aa  151  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  37.89 
 
 
246 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  35.78 
 
 
271 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  38.71 
 
 
252 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
247 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.77 
 
 
262 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  38.57 
 
 
251 aa  148  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  33.93 
 
 
288 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  36.94 
 
 
258 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  37.16 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  35.02 
 
 
262 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  34.96 
 
 
264 aa  146  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  37.56 
 
 
252 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  36.89 
 
 
292 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  37.33 
 
 
268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  34.82 
 
 
249 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.67 
 
 
251 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  36.24 
 
 
259 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.89 
 
 
273 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  34.82 
 
 
246 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  38.35 
 
 
249 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  35.68 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  33.78 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  35.65 
 
 
263 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  34.29 
 
 
274 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  33.94 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  34.53 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 
296 aa  138  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  36.71 
 
 
300 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  35.89 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  33.18 
 
 
296 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  35.29 
 
 
263 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  36 
 
 
288 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  33.18 
 
 
296 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  33.18 
 
 
296 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  35.89 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  32.6 
 
 
287 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  34.93 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  33.48 
 
 
255 aa  134  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  35.75 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  32.88 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  32.89 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  34.96 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  33.48 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  33.63 
 
 
299 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
258 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  35.89 
 
 
265 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
402 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35.19 
 
 
265 aa  131  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  33.04 
 
 
273 aa  131  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  33.79 
 
 
296 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 
261 aa  131  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  34.67 
 
 
298 aa  131  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.77 
 
 
258 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  35.32 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  32.13 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  32.13 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  32.44 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  35.05 
 
 
311 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  38.01 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  34.67 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  32.6 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  30.73 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4513  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  37.5 
 
 
271 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.19 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  33.63 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  32.75 
 
 
262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.19 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.19 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>