More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81660 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_81660  methionyl-tRNA synthetase, mitochondrial  100 
 
 		 584 aa  1215    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03865  methionyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07820)  41.09 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00060  methionine-tRNA ligase, putative  38.73 
 
 		 582 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000329548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 519 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  36.72 
 
 		 574 aa  338  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 722 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 522 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 511 aa  329  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 514 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 522 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 522 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 515 aa  323  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 525 aa  319  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 522 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 645 aa  319  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 517 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 514 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 628 aa  317  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 516 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 515 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 640 aa  316  7e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11026  methionyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 519 aa  316  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.463568  normal  0.948581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 550 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 650 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 659 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 647 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 509 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 523 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 642 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 663 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 506 aa  312  1e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 525 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 510 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 509 aa  309  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 681 aa  309  9e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 523 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 515 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 515 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 515 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 509 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 509 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0541  methionyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 519 aa  306  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 670 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 521 aa  303  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 519 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 527 aa  302  9e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 533 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 648 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 657 aa  301  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 659 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08580  methionyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 541 aa  300  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 634 aa  300  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 642 aa  300  5e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 508 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 675 aa  300  6e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 648 aa  299  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 644 aa  299  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 702 aa  298  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 536 aa  299  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 667 aa  298  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 650 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 634 aa  297  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 660 aa  298  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0893  methionyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 503 aa  297  4e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 518 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 675 aa  295  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 660 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 660 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 660 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 660 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 660 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 653 aa  293  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 647 aa  293  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 632 aa  292  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 660 aa  292  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3650  methionyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>