More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67826 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_67826  general amino acid permease  100 
 
 		 526 aa  1056    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  56.42 
 
 		 579 aa  615  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  54.28 
 
 		 589 aa  573  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  53.11 
 
 		 554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  54.09 
 
 		 599 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29107  histidine permease  49.32 
 
 		 529 aa  539  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754466 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  49.62 
 
 		 588 aa  519  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  50.29 
 
 		 597 aa  497  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89811  high-affinity glutamine permease  45.03 
 
 		 568 aa  453  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41966  general amino acid permease  44.86 
 
 		 621 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.668272 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01659  amino acid transporter (Eurofung)  45.3 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00286365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28779  high-affinity glutamine permease  41.33 
 
 		 564 aa  402  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0302486 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  35.52 
 
 		 552 aa  326  8.000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  36.43 
 
 		 575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  38.08 
 
 		 533 aa  320  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  35.98 
 
 		 569 aa  315  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  36.63 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  35.9 
 
 		 527 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_11039  general amino acid permease  38.29 
 
 		 518 aa  310  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  36.27 
 
 		 527 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  38.68 
 
 		 583 aa  300  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  36.61 
 
 		 488 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  36.4 
 
 		 488 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  36.61 
 
 		 488 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  36.61 
 
 		 488 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  36.4 
 
 		 488 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  36.61 
 
 		 488 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  36.61 
 
 		 488 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  36.4 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  36.19 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  36.4 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  35.14 
 
 		 567 aa  295  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  36.23 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  36.23 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  36.48 
 
 		 490 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  38.29 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  33.33 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  33.33 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  33.33 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  33.33 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  33.33 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  33.33 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  34.31 
 
 		 526 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  36.24 
 
 		 520 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  34.08 
 
 		 526 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  32.8 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  33.61 
 
 		 536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  33.61 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  37.99 
 
 		 493 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  33.82 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  33.67 
 
 		 526 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  33.67 
 
 		 526 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  33.67 
 
 		 526 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0918  amino acid permease-associated region  36.07 
 
 		 500 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 		 526 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  33.2 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  34.03 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  38.56 
 
 		 496 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  34.03 
 
 		 487 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  37.33 
 
 		 548 aa  280  5e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  34.21 
 
 		 489 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  36.06 
 
 		 500 aa  280  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  34.21 
 
 		 489 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  34.28 
 
 		 488 aa  279  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  33.27 
 
 		 500 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  32.99 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  32.79 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52358  amino acid permease  34.64 
 
 		 487 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.676257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  32.79 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  32.79 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  36.36 
 
 		 490 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  36.3 
 
 		 492 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05800  amino acid transporter, putative  35.18 
 
 		 563 aa  273  7e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  36.45 
 
 		 511 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  36.45 
 
 		 511 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  33.33 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  34.99 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  33.13 
 
 		 479 aa  269  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  33.53 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  35.8 
 
 		 493 aa  267  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  36.23 
 
 		 512 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  34.87 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  34.87 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  34.87 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  36.14 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  35.56 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  36.63 
 
 		 489 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  36.63 
 
 		 489 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  36.63 
 
 		 489 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  36.63 
 
 		 489 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  31.77 
 
 		 511 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  36.63 
 
 		 489 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2751  amino acid permease-associated region  34.08 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  33.66 
 
 		 574 aa  262  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01581  proline transporter (Eurofung)  35.54 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0103942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>