More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05800 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA05800  amino acid transporter, putative  100 
 
 		 563 aa  1153    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  45.7 
 
 		 567 aa  463  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  45.44 
 
 		 583 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  43.92 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  41.05 
 
 		 575 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51094  dicarboxylic amino acid permease  40.54 
 
 		 519 aa  396  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.31766  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04649  amino acid transporter (Eurofung)  42.53 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.410395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  40.34 
 
 		 548 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  38.42 
 
 		 552 aa  347  5e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  35.27 
 
 		 527 aa  340  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  38.02 
 
 		 574 aa  335  9e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04328  amino acid transporter (Eurofung)  36.02 
 
 		 581 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02201  amino acid transporter (Eurofung)  37.12 
 
 		 544 aa  331  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000058324  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  36.7 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  38.35 
 
 		 569 aa  327  5e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  35.29 
 
 		 588 aa  317  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  35.12 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01581  proline transporter (Eurofung)  37.61 
 
 		 519 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0103942 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07242  proline transporter, putative (Eurofung)  36.06 
 
 		 546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.535585 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  35.14 
 
 		 597 aa  300  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01732  Proline-specific permease (Proline transport protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18696]  35.37 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839394  decreased coverage  0.00801022 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57189  Proline-specific permease (Proline transport protein)  36.04 
 
 		 570 aa  295  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  34.06 
 
 		 554 aa  294  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  35.67 
 
 		 589 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  33.88 
 
 		 527 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39044  dicarboxylic amino acid permease  33.46 
 
 		 519 aa  289  8e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.115951 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  34.4 
 
 		 599 aa  286  5e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28502  amino acid permease  35.62 
 
 		 560 aa  286  5.999999999999999e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.545283  normal  0.640618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  32.41 
 
 		 503 aa  286  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  32.41 
 
 		 503 aa  286  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  32.41 
 
 		 503 aa  286  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03876  amino acid transporter (Eurofung)  34.32 
 
 		 547 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.933819  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09280  amino acid transporter (Eurofung)  35.02 
 
 		 617 aa  283  6.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719179  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  32.45 
 
 		 526 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03287  amino acid transporter (Eurofung)  31.48 
 
 		 562 aa  283  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836736  hitchhiker  0.00261923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  31.26 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  31.26 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  31.26 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  31.26 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  31.26 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  33.27 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  31.26 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 		 538 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 		 538 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 		 511 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 		 496 aa  280  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44246  dicarboxylic amino acid permease  34.04 
 
 		 532 aa  279  9e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0830188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 514 aa  279  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  32.32 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  31.46 
 
 		 520 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  31.25 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  31.97 
 
 		 487 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  32.25 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  32.25 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  32.25 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  31.21 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  32.25 
 
 		 489 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  32.07 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  32.25 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  31.21 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  31.92 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  31.97 
 
 		 487 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 		 526 aa  277  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 		 526 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 		 511 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  31.82 
 
 		 490 aa  276  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  32.18 
 
 		 493 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  31.46 
 
 		 489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  32.85 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  34.42 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03359  proline transporter (Eurofung)  40.14 
 
 		 440 aa  273  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  31.33 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  31.33 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  31.33 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  31.33 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  31.33 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  31.33 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  31.33 
 
 		 489 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  31.33 
 
 		 489 aa  273  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  33.26 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  31.36 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 511 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  32.21 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  31.38 
 
 		 492 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  32.36 
 
 		 491 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  32.15 
 
 		 491 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  32.86 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  31.24 
 
 		 511 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 		 493 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.368764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  33.46 
 
 		 489 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  31.81 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  33.01 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67826  general amino acid permease  34.67 
 
 		 526 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>