More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44246 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39044  dicarboxylic amino acid permease  75.72 
 
 		 519 aa  820    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.115951 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44246  dicarboxylic amino acid permease  100 
 
 		 532 aa  1078    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0830188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  35.45 
 
 		 575 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  35.15 
 
 		 572 aa  343  7e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  34.62 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  36.65 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  36.83 
 
 		 583 aa  317  3e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  36.01 
 
 		 574 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05800  amino acid transporter, putative  33.84 
 
 		 563 aa  279  8e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01581  proline transporter (Eurofung)  33.74 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0103942 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04328  amino acid transporter (Eurofung)  31.27 
 
 		 581 aa  276  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03876  amino acid transporter (Eurofung)  32.85 
 
 		 547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.933819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51094  dicarboxylic amino acid permease  32.28 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.31766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28502  amino acid permease  33.46 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.545283  normal  0.640618 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  30.36 
 
 		 552 aa  264  3e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57189  Proline-specific permease (Proline transport protein)  32.36 
 
 		 570 aa  263  8e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03287  amino acid transporter (Eurofung)  29.01 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836736  hitchhiker  0.00261923 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  32.14 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02201  amino acid transporter (Eurofung)  32.09 
 
 		 544 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000058324  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01732  Proline-specific permease (Proline transport protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18696]  34.54 
 
 		 552 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839394  decreased coverage  0.00801022 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  33.46 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  30.14 
 
 		 569 aa  253  6e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07242  proline transporter, putative (Eurofung)  30.89 
 
 		 546 aa  253  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.535585 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04649  amino acid transporter (Eurofung)  30.36 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.410395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  31.19 
 
 		 554 aa  249  6e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  31.56 
 
 		 490 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  30.2 
 
 		 503 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  30.2 
 
 		 503 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  30.2 
 
 		 503 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  30.72 
 
 		 496 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  30.6 
 
 		 527 aa  243  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  31.24 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  31.05 
 
 		 579 aa  240  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  29.64 
 
 		 533 aa  239  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  32.48 
 
 		 597 aa  238  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  30.69 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03359  proline transporter (Eurofung)  35.75 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  30.06 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  30.06 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  30.06 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  30.06 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  30.06 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  30.74 
 
 		 488 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 		 488 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  30.74 
 
 		 488 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  30.74 
 
 		 488 aa  233  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29107  histidine permease  29.42 
 
 		 529 aa  233  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754466 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 497 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  30.74 
 
 		 488 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 497 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  30.27 
 
 		 491 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  30.74 
 
 		 488 aa  233  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  30.74 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  30.74 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  30.53 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  29.03 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  29.03 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  29.75 
 
 		 487 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  29.03 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  29.03 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  29.03 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  29.03 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09280  amino acid transporter (Eurofung)  31.13 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719179  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  31.08 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  29.74 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  30.53 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  29.55 
 
 		 487 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  30.33 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  29.23 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  30.27 
 
 		 536 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  29.28 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 527 aa  229  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00510  amino acid transporter, putative  29.38 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.100955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  29.45 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  28.71 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  30.06 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  29.17 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 526 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  29.17 
 
 		 489 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  30.36 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  29.57 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  28.66 
 
 		 492 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>