More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84246 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  83.2 
 
 		 552 aa  851    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  100 
 
 		 569 aa  1151    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  43.87 
 
 		 527 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  37.99 
 
 		 575 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  38.94 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  37.32 
 
 		 548 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  38.25 
 
 		 490 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  34.8 
 
 		 527 aa  343  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  35.49 
 
 		 588 aa  342  9e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  36.15 
 
 		 488 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  34.86 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  33.04 
 
 		 579 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  37.38 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  35.57 
 
 		 583 aa  334  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  37.26 
 
 		 567 aa  333  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  34.66 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  38.09 
 
 		 497 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  38.09 
 
 		 497 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  35.43 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  35.59 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  35.59 
 
 		 488 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05800  amino acid transporter, putative  38.09 
 
 		 563 aa  331  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  38.54 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  35.59 
 
 		 488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  35.43 
 
 		 488 aa  329  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  35.39 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  35.39 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29107  histidine permease  34.25 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  35.24 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  37.07 
 
 		 514 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  35.04 
 
 		 488 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  36.61 
 
 		 500 aa  325  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  37.68 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  37.68 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  36.77 
 
 		 496 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  37.68 
 
 		 511 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  36.84 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  36.51 
 
 		 520 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  35.44 
 
 		 599 aa  323  5e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  36.4 
 
 		 589 aa  323  6e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  36.13 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  36.13 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  36.13 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  36.13 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  36.13 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  36.13 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  37.06 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  37.06 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  38.45 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  37.63 
 
 		 493 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04328  amino acid transporter (Eurofung)  35.82 
 
 		 581 aa  318  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  35.9 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  36.93 
 
 		 526 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  36.65 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 		 526 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  35.44 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  35.44 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  35.44 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  36.18 
 
 		 509 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 		 511 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  36.51 
 
 		 513 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  36.21 
 
 		 489 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  36.98 
 
 		 487 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  36.46 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  34.95 
 
 		 510 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  36.78 
 
 		 487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  36.07 
 
 		 597 aa  310  5e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 511 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  35.48 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  35.48 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  35.48 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  36 
 
 		 506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  36.88 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  36.88 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  36.88 
 
 		 526 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  35.22 
 
 		 492 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  35.82 
 
 		 489 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  34.16 
 
 		 512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  34.78 
 
 		 490 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03287  amino acid transporter (Eurofung)  33.33 
 
 		 562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836736  hitchhiker  0.00261923 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1500  amino acid permease-associated region  34.88 
 
 		 491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00425052  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  35.61 
 
 		 526 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0918  amino acid permease-associated region  38.24 
 
 		 500 aa  304  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  36.95 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01732  Proline-specific permease (Proline transport protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18696]  34.91 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839394  decreased coverage  0.00801022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2751  amino acid permease-associated region  37.55 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  37.14 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  35.35 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.368764 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01581  proline transporter (Eurofung)  35.88 
 
 		 519 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0103942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  37.41 
 
 		 510 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  36.78 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>