More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29107 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29107  histidine permease  100 
 
 		 529 aa  1070    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754466 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  52.07 
 
 		 589 aa  561  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  46.44 
 
 		 579 aa  524  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  46.5 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67826  general amino acid permease  49.32 
 
 		 526 aa  497  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408905  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  44.86 
 
 		 588 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  46.5 
 
 		 599 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  45.22 
 
 		 597 aa  467  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89811  high-affinity glutamine permease  42.27 
 
 		 568 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41966  general amino acid permease  40.84 
 
 		 621 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.668272 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01659  amino acid transporter (Eurofung)  44.89 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00286365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28779  high-affinity glutamine permease  39.4 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0302486 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  36 
 
 		 575 aa  336  5e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  35.91 
 
 		 572 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  34.34 
 
 		 569 aa  323  6e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  34.87 
 
 		 527 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  34.27 
 
 		 552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_11039  general amino acid permease  35.03 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.154814 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  33.46 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  34.49 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  31.94 
 
 		 527 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  32.04 
 
 		 487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  33.89 
 
 		 488 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 526 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  33.68 
 
 		 488 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  33.55 
 
 		 479 aa  283  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  31.84 
 
 		 487 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  34.06 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  33.47 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  33.84 
 
 		 488 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  33.89 
 
 		 488 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  33.47 
 
 		 488 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  31.87 
 
 		 567 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  33.26 
 
 		 488 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  33.26 
 
 		 488 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  32.44 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  34.77 
 
 		 496 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 488 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  31.55 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  30.83 
 
 		 503 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  30.83 
 
 		 503 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  30.83 
 
 		 503 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 		 488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  32.59 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  32.04 
 
 		 492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  32.96 
 
 		 526 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  31.5 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  31.82 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  31.82 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  31.82 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  31.82 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  31.82 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  31.82 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  33.11 
 
 		 526 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  34.03 
 
 		 500 aa  272  9e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  31.08 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  30.74 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  31.79 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  31.79 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  31.79 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  31.85 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  31.34 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  33.72 
 
 		 526 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 511 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  33.87 
 
 		 513 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 511 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  33.72 
 
 		 526 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  33.72 
 
 		 526 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 538 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  31.63 
 
 		 510 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  32.95 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 538 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  31.34 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  33.8 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  31.34 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  31.34 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  31.34 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  31.34 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1500  amino acid permease-associated region  31.8 
 
 		 491 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00425052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  30.62 
 
 		 489 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  34.27 
 
 		 509 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  30.62 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  31.53 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  34.42 
 
 		 497 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  34.42 
 
 		 497 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 		 511 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  31.03 
 
 		 491 aa  263  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  31.46 
 
 		 496 aa  263  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>