More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41966 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_41966  general amino acid permease  100 
 
 		 621 aa  1265    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.668272 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  48.9 
 
 		 589 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  44.25 
 
 		 579 aa  498  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  42.74 
 
 		 599 aa  468  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  43.56 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  44.78 
 
 		 588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  42.98 
 
 		 597 aa  445  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29107  histidine permease  40.84 
 
 		 529 aa  439  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754466 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67826  general amino acid permease  44.67 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89811  high-affinity glutamine permease  41.31 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28779  high-affinity glutamine permease  36.95 
 
 		 564 aa  347  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0302486 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  35.7 
 
 		 575 aa  335  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  36.35 
 
 		 572 aa  323  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01659  amino acid transporter (Eurofung)  38.4 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00286365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 496 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  36.65 
 
 		 490 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 		 511 aa  290  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 		 511 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  33.06 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  33.6 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  34.41 
 
 		 488 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  34.21 
 
 		 488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  34.39 
 
 		 503 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  34.39 
 
 		 503 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  34.39 
 
 		 503 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  34.01 
 
 		 488 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  34.01 
 
 		 488 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  32.53 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  33.81 
 
 		 488 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  35.55 
 
 		 492 aa  281  3e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  280  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  33.81 
 
 		 488 aa  280  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  33.81 
 
 		 488 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  33.81 
 
 		 488 aa  280  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  33.6 
 
 		 488 aa  280  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  34.03 
 
 		 489 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  33.89 
 
 		 493 aa  279  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  34.03 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  34.03 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  34.03 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  33.6 
 
 		 488 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  34.45 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  34.38 
 
 		 491 aa  279  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  32.5 
 
 		 536 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  34.03 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  34.24 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  33.61 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  32.26 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  33.27 
 
 		 569 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  32.61 
 
 		 520 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  32.61 
 
 		 520 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  32.61 
 
 		 520 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  32.61 
 
 		 520 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  32.61 
 
 		 520 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  32.61 
 
 		 520 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  33.96 
 
 		 493 aa  278  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.368764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  34.43 
 
 		 512 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  33.4 
 
 		 488 aa  277  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 511 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  34.66 
 
 		 491 aa  276  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  32.79 
 
 		 526 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 538 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 538 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  34.16 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  34.09 
 
 		 510 aa  275  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  33.08 
 
 		 552 aa  273  5.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 526 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 526 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 526 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  33.54 
 
 		 526 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_11039  general amino acid permease  36.79 
 
 		 518 aa  273  9e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  33.15 
 
 		 527 aa  273  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  33.54 
 
 		 506 aa  273  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  33.73 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  33.4 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  32.43 
 
 		 527 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  31.79 
 
 		 567 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  32.92 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  32.64 
 
 		 583 aa  266  8e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  34.42 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  32.86 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0918  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 500 aa  263  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1500  amino acid permease-associated region  32.28 
 
 		 491 aa  263  8e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00425052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  33.26 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  33.47 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  31.08 
 
 		 500 aa  262  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  34.2 
 
 		 489 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  33.06 
 
 		 487 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  31.59 
 
 		 509 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>