49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38880 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  72.62 
 
 		 284 aa  353  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  87.36 
 
 		 232 aa  334  5.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  73.13 
 
 		 226 aa  301  6.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  61.14 
 
 		 203 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  44.44 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  45.93 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  45.71 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  44.77 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  43.89 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  44.05 
 
 		 181 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  40.7 
 
 		 186 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  43.37 
 
 		 186 aa  131  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  41.62 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  40.8 
 
 		 186 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  43.4 
 
 		 176 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  38.37 
 
 		 181 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  41.88 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  38.98 
 
 		 187 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  37.79 
 
 		 181 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  37.93 
 
 		 186 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  36.78 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  49.63 
 
 		 142 aa  122  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  42.41 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  37.36 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  43.02 
 
 		 181 aa  121  9e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  40.35 
 
 		 186 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  39.52 
 
 		 189 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  42.24 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  40.37 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  36.78 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  37.36 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  36.63 
 
 		 181 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  36.63 
 
 		 181 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  37.87 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  38.96 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  37.35 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  38.51 
 
 		 183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  41.1 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  38.36 
 
 		 193 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  36.93 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  37.72 
 
 		 184 aa  98.6  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  37.42 
 
 		 184 aa  98.6  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  34.71 
 
 		 174 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  36.48 
 
 		 184 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  31.95 
 
 		 181 aa  92  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  34.59 
 
 		 184 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  32.76 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  27.84 
 
 		 123 aa  49.3  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>