49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01090 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  87.36 
 
 		 247 aa  335  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  77.45 
 
 		 284 aa  324  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  75.28 
 
 		 226 aa  289  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  60.57 
 
 		 203 aa  228  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  47.09 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  45.93 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  46.75 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  46.15 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  44.19 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  43.02 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  43.53 
 
 		 187 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  43.98 
 
 		 186 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  40.7 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  40.12 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  42.05 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  42.5 
 
 		 183 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  38.95 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  42.26 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  39.18 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  38.95 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  39.18 
 
 		 186 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  41.76 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  38.37 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  38.6 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  38.51 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  41.18 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  40 
 
 		 184 aa  121  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  44.59 
 
 		 186 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  40.49 
 
 		 176 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  37.93 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  40.59 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  40.91 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  41.42 
 
 		 181 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  39.24 
 
 		 183 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  47.41 
 
 		 142 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  37.06 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  36.65 
 
 		 183 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  36.48 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  38.1 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  35.85 
 
 		 193 aa  98.6  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  33.71 
 
 		 174 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  37.04 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  31.82 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  34.59 
 
 		 184 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  35.22 
 
 		 188 aa  92  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  34.81 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  30.06 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  25.77 
 
 		 123 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>