49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0595 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  88.52 
 
 		 206 aa  330  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  79.67 
 
 		 183 aa  290  9e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  65.38 
 
 		 184 aa  248  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  58.56 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  59.67 
 
 		 186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  58.56 
 
 		 186 aa  221  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  58.56 
 
 		 186 aa  221  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  58.66 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  57.54 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  55.25 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  57.22 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  54.7 
 
 		 186 aa  204  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  53.63 
 
 		 181 aa  201  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  52.46 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  53.8 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  51.7 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  53.04 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  49.43 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  48.3 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  48.3 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  49.18 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  48.02 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  48.3 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  46.93 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  49.44 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  44.13 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  52.15 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  44.13 
 
 		 199 aa  160  7e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  51.53 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  47.75 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  47.37 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  43.58 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  43.58 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  44.2 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  43.98 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  42.07 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  42.7 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  42.7 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  51.45 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  39.02 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  39.26 
 
 		 291 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  39.24 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  38.55 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  37.35 
 
 		 247 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  36.25 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  36.75 
 
 		 284 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  34.46 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  27.54 
 
 		 123 aa  48.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>