49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1388 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  84.07 
 
 		 186 aa  307  5.9999999999999995e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  75.68 
 
 		 186 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  75.82 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  74.73 
 
 		 189 aa  271  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  59.89 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  59.89 
 
 		 186 aa  224  8e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  59.34 
 
 		 186 aa  221  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  58.79 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  55.25 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  57.69 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  53.3 
 
 		 186 aa  207  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  54.4 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  52.2 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  50.55 
 
 		 184 aa  194  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  49.46 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  50 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  50 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  50.85 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  53.29 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  50.56 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  50 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  50.85 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  47.8 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  48.19 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  45.25 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  44.69 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  43.58 
 
 		 201 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  47.19 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  43.58 
 
 		 199 aa  160  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  47.75 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  45.71 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  46.07 
 
 		 181 aa  158  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  46.63 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  43.6 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  45.65 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  43.29 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  41.57 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  43.64 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  43.53 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  42.69 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  41.62 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  36.63 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  45.71 
 
 		 142 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  39.08 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  35.87 
 
 		 291 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  34.64 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  33.53 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  29.91 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>