49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1917 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  43.58 
 
 		 186 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  43.58 
 
 		 186 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  42.46 
 
 		 186 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  42.46 
 
 		 186 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  40.78 
 
 		 181 aa  125  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  41.34 
 
 		 185 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  40.25 
 
 		 183 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  39.26 
 
 		 183 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  37.43 
 
 		 206 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  42.41 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  37.99 
 
 		 186 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  38.24 
 
 		 183 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  35.87 
 
 		 187 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  35.87 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  36.57 
 
 		 186 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  37.34 
 
 		 189 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  35.22 
 
 		 184 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  34.2 
 
 		 187 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  43.12 
 
 		 181 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  37.74 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  36.02 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  36.47 
 
 		 181 aa  99.4  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  38.99 
 
 		 181 aa  99  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  32.76 
 
 		 184 aa  98.2  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  34.59 
 
 		 184 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  37.29 
 
 		 201 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  36.88 
 
 		 176 aa  97.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  35.8 
 
 		 193 aa  96.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  35.8 
 
 		 181 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  37.34 
 
 		 181 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  37.82 
 
 		 194 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  31.55 
 
 		 186 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  39.49 
 
 		 197 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  35.8 
 
 		 181 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  39.49 
 
 		 199 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  32.16 
 
 		 184 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  35.59 
 
 		 199 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  33.96 
 
 		 192 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  32.7 
 
 		 184 aa  92.4  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  37.34 
 
 		 181 aa  91.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  36.36 
 
 		 174 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  32.76 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  41.98 
 
 		 142 aa  86.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  31.61 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  33.33 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  30.06 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  32 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  32.5 
 
 		 123 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>