49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1496 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  88.52 
 
 
183 aa  330  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  78.02 
 
 
183 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  65.38 
 
 
184 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  60.11 
 
 
186 aa  222  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  60.34 
 
 
185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  58.99 
 
 
186 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  58.43 
 
 
186 aa  215  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  58.99 
 
 
186 aa  215  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  56.42 
 
 
186 aa  204  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  56.98 
 
 
186 aa  204  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  53.07 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  52.49 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  49.46 
 
 
187 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  51.63 
 
 
189 aa  191  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  51.09 
 
 
186 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  47.73 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  49.17 
 
 
186 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  47.73 
 
 
193 aa  177  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  47.16 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  46.02 
 
 
192 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  48.02 
 
 
199 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  47.13 
 
 
183 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  46.89 
 
 
199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  46.02 
 
 
188 aa  165  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  44.44 
 
 
184 aa  164  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  44.44 
 
 
184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  46.33 
 
 
197 aa  162  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  46.33 
 
 
201 aa  159  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  52.2 
 
 
181 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  52.2 
 
 
181 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  52.2 
 
 
181 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  45.76 
 
 
194 aa  156  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  51.57 
 
 
181 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  49.68 
 
 
181 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  43.37 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  46.15 
 
 
186 aa  141  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  41.46 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  41.01 
 
 
187 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  51.45 
 
 
142 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  40.91 
 
 
232 aa  119  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  37.43 
 
 
291 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  35.9 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  38.96 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  35.26 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  36.75 
 
 
284 aa  108  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  38.75 
 
 
181 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  35.47 
 
 
174 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  28.79 
 
 
123 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>