49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2629 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  100 
 
 		 185 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  84.32 
 
 		 186 aa  308  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  83.78 
 
 		 186 aa  306  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  83.24 
 
 		 186 aa  305  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  83.78 
 
 		 186 aa  305  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  73.66 
 
 		 186 aa  268  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  70.81 
 
 		 186 aa  257  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  60.34 
 
 		 206 aa  218  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  58.66 
 
 		 183 aa  218  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  57.69 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  57.14 
 
 		 186 aa  207  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  54.44 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  57.38 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  56.28 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  52.22 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  52.46 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  53.85 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  46.29 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  43.33 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  44.26 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  52.84 
 
 		 181 aa  164  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  47.78 
 
 		 199 aa  164  9e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  53.25 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  47.13 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  51.7 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  45.16 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  41.81 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  45.76 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  45.16 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  44.63 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  50.57 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  47.28 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  50.57 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  45.16 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  45.29 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  42.7 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  44.38 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  45.68 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  41.95 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  35.8 
 
 		 226 aa  121  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  41.34 
 
 		 291 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  37.87 
 
 		 247 aa  115  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  37.06 
 
 		 232 aa  115  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  46.38 
 
 		 142 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  39.66 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  37.08 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  36.47 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  35.09 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  31.88 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>