48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2006 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  86.96 
 
 		 184 aa  323  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  79.35 
 
 		 193 aa  299  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  78.8 
 
 		 184 aa  294  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  72.83 
 
 		 188 aa  280  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  74.46 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  70.65 
 
 		 184 aa  266  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  70.49 
 
 		 183 aa  263  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  56.29 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  48.09 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  47.8 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  46.93 
 
 		 183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  50.6 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  48.55 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  45.76 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  45.76 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  45.2 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  45.2 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  45.76 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  44.44 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  43.5 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  45.76 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  45.76 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  46.3 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  38.98 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  41.52 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  39.77 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  37.87 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  39.2 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  39.77 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  40.8 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  40.68 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  39.2 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  36.59 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  43.48 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  40.91 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  40.91 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  43.87 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  42.86 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  43.75 
 
 		 142 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  36.31 
 
 		 226 aa  94.7  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  32.22 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  32.16 
 
 		 291 aa  93.2  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  29.7 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  34.59 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  36.31 
 
 		 284 aa  84.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  34.81 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  29.65 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>