81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48802 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48802  predicted protein  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48801  predicted protein  39.6 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.14 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  45.65 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  47.83 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.18 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  50 
 
 
106 aa  48.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 
467 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
129 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  45 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  27.35 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  44.19 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32376  predicted protein  50 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  29.47 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  48.84 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  48.84 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  48.84 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  30.51 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  46.34 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  52.38 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  31.08 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  31.08 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  31.08 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  31.08 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  31.08 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  50 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48570  predicted protein  42.5 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0224586  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  28 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  32.56 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  26.19 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1513  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 
298 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28981  predicted protein  48.84 
 
 
240 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  28.97 
 
 
119 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.8 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  28.04 
 
 
119 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  47.5 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  32.67 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.19 
 
 
388 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  48.72 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 
129 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  35.64 
 
 
327 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 
120 aa  40.8  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  29.09 
 
 
115 aa  40.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 
388 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  34.55 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  45 
 
 
132 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
124 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>