53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43673 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43673  predicted protein  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00220512  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32784  predicted protein  30.16 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0879664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  29.7 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  29.7 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  29.7 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  29.7 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  29.7 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  29.7 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  29.7 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  29.7 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  29.7 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  26.21 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  34.21 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  26.73 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.33 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  25.51 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  25.51 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  25.51 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  25.51 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  25.51 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  26.74 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  29.19 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  31.51 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  24.77 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  27.89 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  24.27 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  24.27 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  28.18 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  24.27 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  32.43 
 
 		 625 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  27.95 
 
 		 198 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  29.81 
 
 		 203 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  27.95 
 
 		 198 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.67 
 
 		 267 aa  45.8  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  24.3 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35072  Rhomboid family proteins Function unknown  23.58 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.477388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  29.85 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48717  predicted protein  28.99 
 
 		 687 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.808237  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43539  predicted protein  20 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  26.8 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  27.46 
 
 		 487 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  27.46 
 
 		 487 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  50 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  25.41 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.03 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  27.27 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.87 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  41.3 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  26.23 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  26.6 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>