112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43222 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  100 
 
 
919 aa  1908    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  33.14 
 
 
601 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  32.28 
 
 
669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  30.17 
 
 
563 aa  249  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  40.06 
 
 
603 aa  231  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  40.06 
 
 
620 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  40.06 
 
 
618 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  35.41 
 
 
546 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  38.77 
 
 
567 aa  215  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  34.13 
 
 
605 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  34.9 
 
 
572 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  40.12 
 
 
573 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  40.12 
 
 
573 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  36.47 
 
 
584 aa  205  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  33.33 
 
 
657 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  39.81 
 
 
573 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  36.1 
 
 
620 aa  202  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  39.78 
 
 
612 aa  201  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  37.23 
 
 
579 aa  201  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  36.32 
 
 
585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  39.13 
 
 
618 aa  197  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  37.28 
 
 
589 aa  197  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  36.36 
 
 
585 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  36.63 
 
 
589 aa  195  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  38.62 
 
 
613 aa  193  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  36.5 
 
 
551 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  38.23 
 
 
690 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  36 
 
 
591 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  36.04 
 
 
587 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  35.9 
 
 
617 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  36.53 
 
 
578 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  33.61 
 
 
572 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  37.57 
 
 
589 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  35.28 
 
 
584 aa  189  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  35.28 
 
 
584 aa  189  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  35.28 
 
 
584 aa  189  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  35.65 
 
 
584 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  35.28 
 
 
584 aa  189  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  34.75 
 
 
581 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  35.65 
 
 
584 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  35.28 
 
 
584 aa  188  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  35.6 
 
 
547 aa  188  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  34.18 
 
 
581 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  34.18 
 
 
581 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  37.77 
 
 
678 aa  187  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  33.26 
 
 
581 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  36.76 
 
 
584 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  33.59 
 
 
594 aa  186  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  33.93 
 
 
581 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  36.44 
 
 
609 aa  184  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  36.44 
 
 
609 aa  184  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  34.98 
 
 
581 aa  184  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  31.33 
 
 
588 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  34.02 
 
 
581 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  33.72 
 
 
619 aa  182  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  38.1 
 
 
610 aa  181  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  35.78 
 
 
592 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  39.67 
 
 
591 aa  181  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  35.28 
 
 
619 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  35.59 
 
 
621 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  36.12 
 
 
670 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  35.69 
 
 
597 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  35.61 
 
 
541 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  35.94 
 
 
606 aa  177  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  38.04 
 
 
550 aa  177  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  36.92 
 
 
669 aa  177  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  34.72 
 
 
606 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  34.08 
 
 
599 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  35.29 
 
 
551 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  30.52 
 
 
650 aa  174  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  33.57 
 
 
613 aa  172  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  36.42 
 
 
545 aa  172  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  35.54 
 
 
622 aa  171  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  32.23 
 
 
623 aa  170  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  35.89 
 
 
546 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  36.62 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  36.62 
 
 
595 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  34.86 
 
 
633 aa  164  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  35.79 
 
 
521 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  34.57 
 
 
620 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  49.08 
 
 
651 aa  154  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  33.13 
 
 
572 aa  154  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  32.55 
 
 
585 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  32.52 
 
 
584 aa  144  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  32.26 
 
 
585 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  31.67 
 
 
585 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  32.72 
 
 
585 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  32.72 
 
 
585 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  32.72 
 
 
585 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  29.87 
 
 
517 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1281  Carbamoyltransferase  33.54 
 
 
545 aa  142  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  32.72 
 
 
585 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  30.72 
 
 
585 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  30.72 
 
 
585 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  31.58 
 
 
548 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  31.9 
 
 
584 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  27.91 
 
 
656 aa  136  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  32.32 
 
 
574 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  27.89 
 
 
525 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  28.53 
 
 
509 aa  128  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>