More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1739 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1739  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2076  Ppx/GppA phosphatase  48.63 
 
 		 294 aa  144  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4534  Ppx/GppA phosphatase  47.62 
 
 		 296 aa  140  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3684  Ppx/GppA phosphatase  47.62 
 
 		 293 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131918  normal  0.207206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2808  Ppx/GppA phosphatase  47.97 
 
 		 294 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1637  Ppx/GppA phosphatase  42.57 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0606324  normal  0.0168226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11908  putative exopolyphosphatase  47.24 
 
 		 278 aa  120  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4256  Ppx/GppA phosphatase  43.45 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.429083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0350  Ppx/GppA phosphatase  41.06 
 
 		 300 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1432  Ppx/GppA phosphatase  41.1 
 
 		 312 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.798676  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  32.83 
 
 		 505 aa  92  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  34 
 
 		 505 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  36.11 
 
 		 508 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.23 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0472  Ppx/GppA phosphatase  37.5 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  31.03 
 
 		 549 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  38.39 
 
 		 510 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  32.56 
 
 		 321 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  33.75 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  35.57 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  35.86 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  35.17 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  35.42 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 		 519 aa  78.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  31.41 
 
 		 553 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  38 
 
 		 307 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3247  Ppx/GppA phosphatase  30.27 
 
 		 311 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  31.03 
 
 		 523 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  32.19 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  30.2 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  36.91 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  36.05 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  34.18 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  29.53 
 
 		 498 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  34.69 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  27.96 
 
 		 548 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  33.78 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  36.05 
 
 		 322 aa  74.7  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  29.31 
 
 		 544 aa  74.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  31.13 
 
 		 375 aa  74.7  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  34.25 
 
 		 304 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  31.48 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  29.31 
 
 		 544 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  29.53 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  33.1 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  31.08 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10505  hypothetical protein  30.28 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0443339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  34.25 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  31.33 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  33.96 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  31.82 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  30.26 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6144  Ppx/GppA phosphatase  32.64 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  30.82 
 
 		 520 aa  72.8  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  31.79 
 
 		 532 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  38.62 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 		 535 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  28.97 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.97 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  28.97 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  28.97 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.97 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  32.93 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  28.97 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  28.97 
 
 		 504 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 		 370 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  28.86 
 
 		 603 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  30.57 
 
 		 319 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 		 338 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  31.54 
 
 		 519 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  30.2 
 
 		 510 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0833  Ppx/GppA phosphatase  30.61 
 
 		 355 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0398772  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.82 
 
 		 326 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 504 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  32.24 
 
 		 513 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 504 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 504 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  31.72 
 
 		 531 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  28.97 
 
 		 504 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.87 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  29.86 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.98 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  30.41 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  29.94 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  30.67 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  32.1 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  30.67 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  32.69 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  31.58 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.41 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  32.88 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27230  exopolyphosphatase  34.03 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104101  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  30.67 
 
 		 531 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>