More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0889 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  85.69 
 
 
504 aa  884    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  68.36 
 
 
527 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
535 aa  1091    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  85.69 
 
 
504 aa  884    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  67.78 
 
 
510 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  85.69 
 
 
504 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  90.26 
 
 
503 aa  933    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  86.65 
 
 
504 aa  869    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  87.25 
 
 
504 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  66.99 
 
 
512 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  85.66 
 
 
504 aa  882    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  85.69 
 
 
504 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  67.19 
 
 
512 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  88.61 
 
 
509 aa  931    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  68.24 
 
 
510 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  85.69 
 
 
504 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  87.25 
 
 
504 aa  875    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  87.28 
 
 
504 aa  894    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  87.05 
 
 
504 aa  875    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  87.25 
 
 
504 aa  896    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  87.25 
 
 
504 aa  875    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  85.69 
 
 
504 aa  884    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  85.69 
 
 
504 aa  884    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  59.77 
 
 
520 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  54.58 
 
 
512 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  53.69 
 
 
499 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  52.46 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  49.7 
 
 
499 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 
491 aa  432  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  43.56 
 
 
500 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  42.45 
 
 
501 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  44.49 
 
 
497 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  43.03 
 
 
500 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  43.03 
 
 
500 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  43.15 
 
 
500 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  41.06 
 
 
526 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  42.62 
 
 
500 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  41.8 
 
 
520 aa  360  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  43.18 
 
 
500 aa  359  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  43.97 
 
 
501 aa  359  9e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  42.89 
 
 
506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  41.67 
 
 
499 aa  356  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  42.66 
 
 
501 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  42.21 
 
 
500 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  44.61 
 
 
477 aa  350  5e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  40.73 
 
 
500 aa  349  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  39.83 
 
 
508 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  42.31 
 
 
499 aa  343  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  43.56 
 
 
493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  43.56 
 
 
493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  41.65 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  38.14 
 
 
519 aa  336  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  38.14 
 
 
519 aa  336  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  42.48 
 
 
509 aa  335  9e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  41.48 
 
 
505 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1294  Ppx/GppA phosphatase  41.31 
 
 
520 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  37.94 
 
 
519 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2310  Ppx/GppA phosphatase  42.57 
 
 
506 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  42.55 
 
 
508 aa  333  5e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  42.03 
 
 
512 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  38.48 
 
 
516 aa  329  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  43.1 
 
 
506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  41.49 
 
 
508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  37.95 
 
 
520 aa  327  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.1 
 
 
513 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.1 
 
 
513 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.1 
 
 
513 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.1 
 
 
513 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.1 
 
 
513 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.1 
 
 
513 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.1 
 
 
513 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  42.28 
 
 
526 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  38.54 
 
 
505 aa  324  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  37.73 
 
 
513 aa  323  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.1 
 
 
513 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  38.89 
 
 
509 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  37.9 
 
 
513 aa  323  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  37.75 
 
 
509 aa  322  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  37.45 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  37.45 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  37.45 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  37.45 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  37.35 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  36.22 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  43.06 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  36.22 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  37.45 
 
 
513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  42.08 
 
 
508 aa  319  7.999999999999999e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  38.52 
 
 
505 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  41.34 
 
 
494 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  41.02 
 
 
505 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  38.99 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  37.48 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3600  Ppx/GppA phosphatase  43.34 
 
 
514 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  40.88 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  40.88 
 
 
511 aa  306  6e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  36.49 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  36.49 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.22 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  36.49 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>