More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1566 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  100 
 
 
308 aa  628  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  41.98 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  41.61 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  42 
 
 
307 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  41.33 
 
 
311 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  38.54 
 
 
311 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  37.87 
 
 
300 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  37.91 
 
 
300 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  30.32 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
366 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  32.91 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  32.25 
 
 
325 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  31.89 
 
 
288 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  28.38 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  31.83 
 
 
357 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  30.96 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  32.05 
 
 
326 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  30.36 
 
 
305 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  31.27 
 
 
367 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  30.97 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  33.55 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
380 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  32.38 
 
 
363 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  32.11 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
375 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.03 
 
 
531 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  33.65 
 
 
355 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  31.39 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  34.42 
 
 
310 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  29.48 
 
 
378 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  29.25 
 
 
498 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
373 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
360 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  34.21 
 
 
311 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
435 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  29.05 
 
 
375 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  30.74 
 
 
308 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  29.53 
 
 
393 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  28.76 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  29.59 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  29.56 
 
 
504 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  30.35 
 
 
433 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  28.93 
 
 
498 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  29.75 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  30.35 
 
 
520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  30.5 
 
 
319 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  28.38 
 
 
513 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  29.71 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27.39 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  31.46 
 
 
303 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 
513 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  29.61 
 
 
374 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 
317 aa  116  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  28.87 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.72 
 
 
507 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  28.87 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  32.7 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  26.11 
 
 
531 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  29.75 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  30.48 
 
 
603 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  28.25 
 
 
527 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  28.87 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  28.7 
 
 
446 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  25.48 
 
 
531 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 
519 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
413 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  25.8 
 
 
531 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  28.48 
 
 
514 aa  112  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  28.32 
 
 
370 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  28.9 
 
 
500 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  32.13 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  29.55 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 
520 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1297  Ppx/GppA phosphatase  31.58 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.651374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  29.55 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  29.55 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  29.28 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  29.32 
 
 
520 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  28.15 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
318 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  27.93 
 
 
389 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  28.57 
 
 
526 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  30.91 
 
 
319 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  27.73 
 
 
521 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  27.54 
 
 
511 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  28.23 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  28.2 
 
 
506 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.53 
 
 
532 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
312 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
502 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
315 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>