More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4256 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4256  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
292 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.429083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2808  Ppx/GppA phosphatase  68.15 
 
 
294 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.704243  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1432  Ppx/GppA phosphatase  52.76 
 
 
312 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.798676  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4534  Ppx/GppA phosphatase  45.99 
 
 
296 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2076  Ppx/GppA phosphatase  43.6 
 
 
294 aa  248  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3684  Ppx/GppA phosphatase  44.48 
 
 
293 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131918  normal  0.207206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1637  Ppx/GppA phosphatase  43.11 
 
 
298 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0606324  normal  0.0168226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11908  putative exopolyphosphatase  42.26 
 
 
278 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0350  Ppx/GppA phosphatase  40.42 
 
 
300 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  30.61 
 
 
511 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  32.23 
 
 
303 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1739  hypothetical protein  43.45 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  28.91 
 
 
508 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  29.04 
 
 
553 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.45 
 
 
532 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 
500 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  27.72 
 
 
500 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  26.47 
 
 
545 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  29 
 
 
519 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  28.48 
 
 
300 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
300 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  26.23 
 
 
548 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  26.8 
 
 
545 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 
502 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  26.8 
 
 
545 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  28.75 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
570 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  25.16 
 
 
549 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  25.57 
 
 
539 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  26.16 
 
 
505 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  28.01 
 
 
550 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.47 
 
 
544 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.47 
 
 
544 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  25.58 
 
 
513 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  24.41 
 
 
510 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  28.15 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  27.01 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  27.12 
 
 
505 aa  90.5  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  27.54 
 
 
531 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  26.1 
 
 
374 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2403  Ppx/GppA phosphatase  27.04 
 
 
533 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  27.69 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
311 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  27.06 
 
 
523 aa  89  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  27.18 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  27.48 
 
 
531 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
507 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  26.56 
 
 
534 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  26.38 
 
 
557 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  25.82 
 
 
544 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  27.56 
 
 
550 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  27.53 
 
 
319 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  24.24 
 
 
502 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  27.21 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  28.2 
 
 
531 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  27.15 
 
 
311 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  26.51 
 
 
497 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  23.76 
 
 
501 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  26.91 
 
 
307 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  28.57 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  26.25 
 
 
511 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  27.87 
 
 
519 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  26.25 
 
 
510 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  26.02 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  26.9 
 
 
514 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  26.91 
 
 
488 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  26.89 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.41 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  24.58 
 
 
506 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  26.62 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  31.34 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  28.25 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  23.41 
 
 
524 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  25.91 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  23.51 
 
 
508 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  26.76 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  26.47 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  27.96 
 
 
499 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  24.76 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  25.95 
 
 
519 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  26.78 
 
 
512 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  26.91 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  25.71 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  26.23 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  23.86 
 
 
492 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  25.32 
 
 
521 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.58 
 
 
512 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.15 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>