More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1993 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  66.03 
 
 
521 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  71.48 
 
 
514 aa  730    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  69.83 
 
 
519 aa  739    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  70.13 
 
 
519 aa  759    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  68.02 
 
 
527 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
519 aa  1060    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  76.55 
 
 
521 aa  795    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  39.73 
 
 
534 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  34.58 
 
 
550 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  35.17 
 
 
570 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 
513 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  32.81 
 
 
513 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  31.19 
 
 
553 aa  259  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  33.27 
 
 
545 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  33.27 
 
 
545 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  32.16 
 
 
549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  32.55 
 
 
523 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  31.84 
 
 
532 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  34 
 
 
544 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  35.54 
 
 
544 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  31.84 
 
 
513 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  33.19 
 
 
545 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  31.95 
 
 
544 aa  242  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.13 
 
 
505 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  34.76 
 
 
549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  34.87 
 
 
550 aa  240  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  31.65 
 
 
519 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  33 
 
 
539 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  31.34 
 
 
531 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  31.54 
 
 
531 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  31.23 
 
 
531 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  32.56 
 
 
519 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  32.73 
 
 
548 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  35.5 
 
 
557 aa  227  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  33.01 
 
 
510 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  33.14 
 
 
511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  33.6 
 
 
511 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  31.71 
 
 
501 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.79 
 
 
531 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.47 
 
 
505 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  31.16 
 
 
500 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.83 
 
 
502 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 
500 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  31.48 
 
 
501 aa  197  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.74 
 
 
520 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.2 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  28.54 
 
 
506 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  30.57 
 
 
501 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  30.34 
 
 
500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  29.79 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  28.14 
 
 
508 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  30.39 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  27.75 
 
 
502 aa  178  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  29.21 
 
 
519 aa  177  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  29.21 
 
 
519 aa  177  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  30.73 
 
 
504 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
500 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  35.08 
 
 
306 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
504 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  29.72 
 
 
501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  28.97 
 
 
519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  30.09 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  32.25 
 
 
535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  28.17 
 
 
501 aa  174  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.51 
 
 
498 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 
500 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  28.48 
 
 
501 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  29.1 
 
 
509 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.29 
 
 
507 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  30.35 
 
 
499 aa  170  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  27.31 
 
 
497 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 
504 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  28.54 
 
 
500 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  30 
 
 
526 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  28.84 
 
 
501 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  29.74 
 
 
513 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  31.5 
 
 
499 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  29.45 
 
 
511 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  29.14 
 
 
516 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  29.76 
 
 
513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  29.8 
 
 
509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  30.3 
 
 
512 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  29.76 
 
 
526 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  29.76 
 
 
526 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  30.37 
 
 
527 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  30.18 
 
 
504 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  29.76 
 
 
526 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  30.18 
 
 
504 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  29.27 
 
 
506 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  30.18 
 
 
504 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>