More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2062 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  96.33 
 
 
300 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  61.79 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  60.93 
 
 
307 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  60.82 
 
 
304 aa  298  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  54.82 
 
 
311 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  54.64 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  37.87 
 
 
308 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  36.31 
 
 
441 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  36.22 
 
 
399 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  35.09 
 
 
446 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  37.25 
 
 
312 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  36.72 
 
 
326 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  35.76 
 
 
375 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  35.16 
 
 
520 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  35.16 
 
 
433 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  35.87 
 
 
367 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  39.94 
 
 
310 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  37.22 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  34.6 
 
 
504 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  35.1 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  38.61 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  36.36 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  34.08 
 
 
519 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  35.33 
 
 
376 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  34.92 
 
 
498 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 
355 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  36.16 
 
 
318 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  34.92 
 
 
498 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  33.12 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  39.86 
 
 
319 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 
321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  37.5 
 
 
328 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  33.96 
 
 
413 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  33.76 
 
 
380 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  35.31 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  34.59 
 
 
375 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  34.42 
 
 
519 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  38.44 
 
 
318 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 
357 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
311 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  35.11 
 
 
603 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  37.71 
 
 
311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  36.27 
 
 
353 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
375 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  34.78 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  32.79 
 
 
521 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  31.05 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  32.33 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  33.88 
 
 
514 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  35.18 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  34.31 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  33 
 
 
513 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  32.25 
 
 
521 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
363 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  33.74 
 
 
333 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  34.56 
 
 
389 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  35.67 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  34.38 
 
 
509 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  36.62 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  35.44 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  33.33 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  32.68 
 
 
519 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  31.58 
 
 
545 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  33.97 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.12 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  33.89 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  36.08 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
502 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  34.32 
 
 
331 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2121  Ppx/GppA phosphatase  34.11 
 
 
338 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  34.43 
 
 
366 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  36.69 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  32.71 
 
 
568 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  33.76 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  31.1 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  32.45 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  34.91 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  32.37 
 
 
531 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  31.89 
 
 
312 aa  126  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  34.05 
 
 
353 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  34.41 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.97 
 
 
303 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  32.82 
 
 
378 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  36.19 
 
 
315 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  34.31 
 
 
513 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  34.32 
 
 
513 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  29.85 
 
 
370 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  35.6 
 
 
331 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
507 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  30.77 
 
 
531 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  37.1 
 
 
305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  32.46 
 
 
355 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  37.05 
 
 
305 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  33.55 
 
 
315 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  32.38 
 
 
550 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  32.45 
 
 
500 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>